Всего в игре есть 5 миссий с второстепенными заданиями. Вы должны закончить их прежде, чем пройдете игру, или если не прошли, их можно переиграть в меню Replay.

• Latveria, Ascension: Уничтожить 4 турели - Расположены по краям мостов (по 2 штуки на мост) по пути к цели миссии.
• Latveria, Reactors: Уничтожить 8 прототипов киборгов - Киборги находятся в гигантских зеленых пробирках. Разбивайте их и киборги выберутся наружу. 6 штук находятся на втором этаже и 2 на третьем
• NYC, Factory Floors: Уничтожить 14 частей (ящиков) технологий Latverian - не должно быть проблем с поиском, они находятся по ходу движения по миссии.
• Washington D.C., Capitol Offense: Уничтожить 4 груды боеприпасов - Все ящики с боеприпасами находятся в области, где фонтаны и нужно уничтожить врагов с ракетными установками. Важно уничтожить все ящики перед тем, как уничтожите шестерых ракетчиков.
• Wakanda, Tribal City: Уничтожить 8 телепортационных лифта - С этим проблем возникнуть не должно, лифты это штуки, которые падают с неба и из них появляются мини-боссы.