Эта история начинается с нападения бандитов на ферму, где живет Эль Ихо и его мама. Женщина решает оставить сына в уединенном монастыре, дабы защитить его от опасности. Впрочем, Эль Ихо вскоре приходит к выводу, что такая жизнь не для него. Он решает сбежать.

El Hijo – игра о скрытности, в которой нет насилия. Жестокость здесь уступает место озорству и игривости маленького ребенка. Главное – оставаться незаметным, так что Эль Ихо часто приходится прятаться.

Поскольку игровой процесс не нуждается в новых механиках, всё происходит естественно, а имеющиеся возможности открываются постепенно, а затем начинают комбинироваться друг с другом для повышения сложности. Такое неординарное решение отлично вписывается в разнообразный мир Эль Ихо, который становится всё более опасным с каждым шагом. Но мальчик не остановится ни перед чем, чтобы достичь своей цели.